La visite guidée se fait à deux voix. Au départ, un guide accompagnateur vous emmène dans les parties les plus proches des villages de Saône ou La Vèze en vous racontant le fonctionnement hydrologique du marais ainsi que sa richesse biologique. Comme dans un jeu, vous cherchez les plantes et les fleurs (selins, pimprenelles ou comarets) qu’il vous a montrées sur un papier. Tout en suivant le petit ruisseau, vous arrivez à la hauteur d’une barrière où Mathieu vous attend. Il est le représentant de la Fédération départementale des chasseurs du Doubs, qui a aménagé et gère cette partie de la réserve de chasse. Un plan d’eau a été creusé, dont les abords sont entretenus par des koniks polski. Ces chevaux rustiques ont remplacé les débroussailleuses. Avec le guide, vous observez la faune. Les bécassines, les perches et les grenouilles ont su se reproduire à nouveau. Finalement, la visite se poursuit pour vous emmener près du Creux de la Roche, point central du marais, où l’ensemble de l’eau s’écoule dans le milieu souterrain. Dans ce gigantesque trou de verdure, vous vous sentez tout petit. Lorsqu’il se remplit avec les crues, cet endroit devient une véritable étendue d'eau dans le village de Saône !

Coin du curieux
Les oiseaux migrateurs, la nature dans l’hiver, les grenouilles et autres amphibiens... D’autres visites à thème, gratuites, sont organisées par le syndicat.